Es mostren les entrades ordenades per rellevància per a la consulta academic crispr. Ordena per data Mostra totes les entrades
Es mostren les entrades ordenades per rellevància per a la consulta academic crispr. Ordena per data Mostra totes les entrades

11 de gener 2024

Com el sector públic i filantròpic va arriscar a la recerca de l'edició genètica

Funding CRISPR: Understanding the role of government and philanthropic institutions in supporting academic research within the CRISPR innovation system 

Sabem que la innovació farmacèutica de l'any 2023 ha estat la primera teràpia aprovada d'edició genètica mitjançant CRISPR. Ara Vertex haurà de pagar una llicència de 100 milions pel cap baix a Broad Institute (Harvard) i al competidor Editas Medicine, per poder comercialitzar-la. 

És un bon moment per preguntar-nos quina ha estat la contribució de finançament públic a la recerca, i per tant si cal considerar fins a quin punt el que s'ha patentat privadament s'ha assolit mitjançant recursos públics.

Això a hores d'ara és complicat de conèixer amb estimacions precises. Però mitjançant la revisió de tots els articles publicats i mirant els reconeixements i agraïments han construït aquest graf que explica prou bé d'on han vingut els recursos per a la recerca, i es veu que fonamentalment venen del govern (punts blaus) i de la filantropia (punts vermells). Aquest és la conclusió del graf referit a Harvard:

The bimodal network model of the Broad/Harvard/MIT system was formed by 28 organizations (12 governmental agencies and 16 philanthropic/charitable organizations) and 111 highly cited papers (14 papers on CRISPR as a biological phenomenon and 97 papers on the development of CRISPR/Cas technologies

 Si cliqueu sobre el gràfic en podreu veure millor el contingut: 


Nota: model de xarxa de cofinançament de la recerca CRISPR/Cas més citada al sistema Broad/Harvard/MIT. Aquesta és una xarxa bimodal de papers i fonts de finançament. La mida dels nodes que representen els articles és una funció del nombre de cites rebudes.
Les vores indiquen quines organitzacions van finançar quins papers. Només els nodes que representen els articles més citats del model de xarxa (més de 500 cites) s'etiqueten amb el seu títol i l'any de publicació i les vores amb llum vermella els relacionen amb la seva organització de finançament.
Els nodes blaus representen agències governamentals, mentre que els nodes vermells representen organitzacions filantròpiques/benèfiques. És important especificar que l'agregació de fonts de finançament està limitada per la informació que els autors proporcionen a la secció d'agraïment dels articles. 

The three clusters are supported by the NIH, which occupies a central position
in the network model, but are cofunded by different sets or organizations. The cluster located in the lower right corner of the network model is formed by papers cofunded by the NIH and the Department of Energy (DoE); a second cluster (upper right corner) is cofunded by a set of philanthropic and governmental organizations; and the third cluster (upper left corner) is cofunded by the Howard Hughes Medical Institute (HHMI) together with a set of U.S. military organizations or programs (Figure 3). There is also an important set of papers exclusively funded by the NIH.
the bimodal network model of the UC system was formed by 15 funding organizations (10 governmental agencies and five philanthropic/charitable organizations) and 117 highly cited papers (59 papers on CRISPR as a biological phenomenon and 58 papers on the development of CRISPR/Cas technologies


In the case of the University of California (UC), the cofunding network model (Figure 4) suggests that the top-cited investigations on CRISPR as a biological phenomenon, which is related to the discovery stage of investigation in which the basis of future technologies are built, were mostly supported by the U.S. Department of Energy and the National Science Foundation. A relatively smaller and less cited set of papers was cosupported by the Burroughs Wellcome Fund together with the National Institutes of Health (NIH; Figure 4). On the other hand, the investigations related to the development of CRISPR/Cas technologies at the UC were mostly supported by the NIH together with the National Science Foundation and the HHMI in two respective clusters of papers (Figure 4). There is also an important set of technological development papers funded by the NIH without the participation of other frequent governmental or philanthropic/charitable funding sources
Doncs aquest és el panorama. Resum, no hi hauria CRISPR si no hi hagués hagut inversió pública i filantròpica a la recerca. Desconeixem la magnitud, però sabem les institucions que hi han participat. Malgrat això, s'ha patentat i per tant a hores d'ara és un bé privat finançat públicament o filantròpicament en bona part. I sobretot això ha passat a l'estadi de la recerca on hi ha més risc, he socialitzat el risc i el resultat ha estat apropiat privadament, una altra volta.


PS. M'ha sorprès el paper dels militars en la tecnologia CRISPR i també del Departament d'Energia.

15 de gener 2021

Precision medicine

 Precision Medicine for Investigators, Practitioners and Providers

Many topics under the same umbrella:

Table of Contents

Introduction

2. Role of genomics in precision medicine

3. High throughput omics in the precision medicine ecosystem

4. Infant gut microbiome

5. Paraprebiotics

6. Fecal transplantation in autoimmune disease

7. Drug pharmacomicrobiomics

8. CRISPR technology for genome editing

9. Engineering microbial living therapeutics

10. Organ on a chip

11. Multicellular in-vitro organ systems

12. The role of biobanks in biomarker development

13. Translational interest of immune profiling

14. Organoid pharmacotyping

15. Large datasets for genomic investigation

16. Modern applications of neurogenetics

17. Genomic profiling in cancer

18. Genomics in pediatrics

19. Genomics of gastric cancer

20.  Genomics of prostate cancer

21. MicroRNAs and inflammation markers in obesity

22. MiRNA sequencing for myocardial infarction screening

23. Cell free DNA in hepatocellular carcinoma

24. Non coding RNA in cancer

25. Germline variants and childhood cancer

26. Pharmacogenomics in cancer

27. Proteomic biomarkers in vireoretinal disease

28. Proteomics in respiratory diseases

29. Cardiovascular proteomics

30. Host genetics, microbiome, and inflammatory bowel disease

31. Sampling, Analyzing, and Integrating Microbiome ‘omics Data in a Translational Clinical Setting

32. Omics and microbiome in sepsis

33. Molecular and omics methods for invasive candidiasis

34. Lipid metabolism in colorectal cancer

35. Salivary volatolome in breast cancer

36. immunodiagnosis in leprosy

37. decision support systems in breast cancer

38. Electronic medical records and diabetes phenotyping

39. Clinical signature of suicide risk

40. Machine learning and cluster analysis in critical care

41. Artificial intelligence in gastroenterology

42. Algorithms for epileptic seizure prediction

43. Precision medicine in ophthalmology

44. Phenotyping COPD

45. Lifestyle medicine

46. Precision medicine for a healthier world

47. Aging and clustering of functional brain networks

48. Nutrigenetics

49. Genome editing in reproductive medicine

50. MRI guided prostate biopsy

51. Precision Nutrition

52. Theranostics in precision oncology

53. Precision medicine in daily practice

54. Imaging in precision medicine

55. Organoid for drug screening

56. Printing of personalized medication using binder jetting 3D printer

57. 3 D printing in orthopedic trauma

58. Consumer genetic testing tools in depression

59. The future of wearables

60. Tumor heterogeneity and drug development

61. Smartphone based clinical diagnosis

62. Smartphone biosensing for point of care use

63. Data security and patient protection

64. Blockchain solutions for healthcare

65. Ethical questions in gene therapy

66. Pitfalls of organ on a chip technologies

67. Regulatory issues of artificial intelligence in radiology

68. Academic industrial alliance

69. The future of precision medicine

70. Precision Medicine Glossary

71. Useful internet sites